La zone et la profondeur de la cornée que le laser va façonner sont programmées préalablement par un logiciel informatique : le chirurgien peut déterminer avec exactitude le diamètre et la profondeur du volet avant l'opération.
Contrairement au kératome, le laser Femtoseconde utilise un anneau de succion qui induit une pression intraoculaire peu élevée. Ceci signifie qu'une pression moindre est exercée sur l'oeil.
Le laser Femtoseconde fonctionne suivant le principe de photodisruption : au moyen d'énergie laser infrarouge, un patron exact de petites cavités contigües est créé juste en-dessous de la surface cornéenne. Le laser opère à une vitesse extrêment élevée : les impulsions sont de 1/15 de seconde ou une femtoseconde. Les impulsions de laser ciblées dissèquent chaque matériel femtosecond au niveau moléculaire sans transmissions thermiques et sans impact sur les tissus environnants.
Chaque impulsion laser forme une bulle microscopique. La photodisruption agit uniquement à l'endroit où la cornée a été sectionnée; le tissu qui se situe en-dehors de la zone déterminée préalablement reste intacte.
En additionnant des milliers de ces impulsions laser les unes à côté des autres, un volet complet est créé dans la cornée : alors que le laser se déplace de part et d'autre sur l'oeil, les bulles adhèrent les unes aux autres et forment de cette manière un volet cornéen.
Le chirurgien peut suivre la totalité de la procédure par le microscope opératoire et par un moniteur spécial.
Après que le capot ait été créé, le chirurgien va soulever le volet avec un instrument conçu à cet effet. Le laser Excimer est alors utilisé pour façonner la cornée de manière à corriger les erreurs réfractives. (voir PROCEDURE LASIK). Enfin, le chirurgien remet le volet cornéen en place.

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